姓名：林忠旭 Lin zhongxu 性别：男
职称：教授 Professor E-mail：linzhongxu@mail.hzau.edu.cn
学历学位：博士 Ph. D 硕/博士生导师：博士生导师 Ph.D. Supervisor
研究方向：棉花种质资源与产量生物学
个人简介:
林忠旭，男，1978年2月出生，教授，博士生导师，山东烟台人。1996－2000年在华中农业大学植物科学技术学院作物遗传育种专业学习，获农学学士学位。2000－2005年在植物科学技术学院攻读作物遗传育种博士学位（硕博连读），于2005年毕业，获得农学博士学位。2005年毕业后于华中农业大学执教，在作物遗传改良全国重点实验室棉花课题组进行研究工作，2009年1－8月在美国新墨西哥州立大学从事学术访问。2013年入选湖北省杰青，2023年入选农业农村部神龙青年英才和新疆天池英才特聘专家。2026年9月于石河子大学农学院棉花生物育种院士工作站工作。长期从事棉花种质资源创制与产量生物学研究。通过基因组学和遗传学系统解析了我国棉花遗传改良机制。通过远缘杂交创制了近2000份陆地棉背景的渐渗系，已利用海岛棉、黄褐棉、毛棉和达尔文棉渐渗系鉴定了棉花重要性状的QTL，发掘了优异种质资源，并图位克隆了多个棉花产量相关的基因。主持国家自然科学基金8项（2007—2023年）、“十三五”转基因专项课题1项、十四五重点研发课题1项，参加省部级科技项目10余项。以第一或通讯作者在Nature Genetics、Journal of Advanced Research、Plant Physiology、Plant Journal、Plant Biotechnology Journal、Theoretical and Applied Genetics、Crop Journal等作物遗传育种领域主流期刊发表论文90余篇；获中国产学研合作创新奖（个人）、国家科技进步奖二等奖（第7）、湖北省技术发明二等奖（第2）、湖北省自然科学一等奖2项（第3和第4）、湖北省科技进步奖一等奖（第4）等科技奖励10项。主持育成棉花新品种3个、合作审定9个；以第一完成人授权发明专利7件，2025年获日内瓦国际专利展银奖。
一、在研科研项目
1. 国家自然科学基金面上项目：qFL-c10-2调控棉花纤维长度的分子机制及其与qFL-c10-1的聚合，2024-2027，主持
2. 国家重点研发计划子课题任务：棉花理想株型和高产基因资源发掘和利用，2022-2027，主持
3. 国家重点研发计划课题：油纤饲兼用型棉花种质资源创制，2023-2027，主持
二、近5年发明专利
1. 林忠旭、陈美林、汪念、王红亚、张献龙。棉花GhGG3基因在调控棉花紧凑株型中的应用，专利号： ZL 202411675263.2，授权公告日：2026年4月28日。
2. 林忠旭、吴迷、张献龙。棉花纤维强度主效基因NTL9BS41及其应用。专利号：ZL 2024 1 1163734.1，授权公告日：2026年3月3日。
3. 林忠旭、杨洋、徐志勇、张献龙。棉花果枝夹角主效基因GhFBA1及其在调控棉花株型中的应用，专利号：ZL202410040354.2，授权公告日：2025年1月14日。
4. 林忠旭、乐愉、张献龙、王涛。一种陆地棉高效遗传转化受体的培育方法及应用。专利号：ZL 202310974030.1，授权公告日：2024年6月21日。
5. 林忠旭、张献龙、刘欣欣、赵文霞。陆地棉棉仁含油量基因GhKAS1的分子标记及其筛选方法。专利号：ZL201810200184.4，授权公告日：2022年4月26日。
三、近5年主要奖励
1. 2023年湖北省自然科学奖一等奖，棉花基因组结构变异及其对性状的遗传调控，排3；
2. 2022年新疆生产建设兵团科学技术进步奖一等奖，优质抗旱棉花种质创新与育种应用，排5；
3. 2021年神农中华农业科技奖，华中农业大学棉花遗传改良创新团队，排8；
4. 2021年大北农科技奖一等奖，棉花基因工程创新与育种应用，排7；
5. 2020年湖北省自然科学奖一等奖，棉花纤维发育与品质形成生物学，排4；
四、近5年发表的论文及著作
1.Yu Le, Meilin Chen, De Zhu, Zhiyong Xu, Chao Fu, Xinhui Xiong, Yuanxue Li, Ningyu Yang, Liuyang Hui, Xianlong Zhang, Zhongxu Lin*. Transcriptional regulation of SWEET15_A01 by MYB44/bHLH3 modulates carbon allocation in cotton ovule and fibre to affect seed and fibre traits. Plant Biotechnology Journal, 2026, 24:1769–1791.
2.Fuyi Duan, Xiubao Hu, Peng Wu, Yuping Zhang, Zhongxu Lin*, Xiaoping Guo*. Exogenous overexpression of the gland development genes Gl2 and Gl3 creates a glandless germplasm in cotton by repressing the expression of endogenous genes. Industrial Crops and Products, 2025, 225, 120484.
3.Yang Yang#, Bo Li#, Yuanxue Li, Zhiyong Xu, Xiaorong Li, Zumuremu Tuerxun, Xunji Chen*, Xianlong Zhang, Zhongxu Lin*. Genetic dissection of lint percentage in an introgression population between Gossypium hirsutum and G. mustelinum. Theoretical and Applied Genetics, 2025, 138:152
4.Chao Fu, Nian Wang, Qingying Meng, Zhiyong Xu, Yu Le, Xianlong Zhang, Yangyang Wei, Chao Shen*, Zhongxu Lin*. Gossypium latifolium genome reveals the genetic basis of domestication of upland cotton from semi-wild races to cultivars. The Crop Journal, 2025, 13: 929–941.
6.Mi Wu, Zhiyong Xu, Chao Fu, Nian Wang, Ruiting Zhang, Yu Le, Meilin Chen, Ningyu Yang, Yuanxue Li, Xianlong Zhang, Ximei Li*, Zhongxu Lin*. NAC transcription factor GbNTL9 modifies the accumulation and organization of cellulose microfibrils to enhance cotton fiber strength. Journal of Advanced Research, 2025, 78: 95–109.
8.乐愉，王涛，张献龙，林忠旭*。陆地棉重组自交系再生能力和遗传转化效率筛选。作物学报，2024, 50 (5): 1172-1180。
9.Yu Le, Wenxia Zhao, Xinxin Liu, Meilin Chen, Xinhui Xiong, Xianlong Zhang, Zhongxu Lin*. Natural variation in GhKASI_A05 modulates cottonseed oil content in Gossypium hirsutum L. Plant Physiology and Biochemistry, 2024, 216, 109159.
10.Yuanxue Li, Tian Yao, Chao Fu, Nian Wang, Zhiyong Xu, Ningyu Yang, Xianlong Zhang, Tianwang Wen*, Zhongxu Lin*. TRANSPARENT TESTA 16 collaborates with the MYB-bHLH-WD40 transcriptional complex to produce brown fiber cotton. Plant Physiology, 2024, 196 (4), 2669–2684.
11.Tianwang Wen*, Weigui Luo, Yuanxue Li, Zhongxu Lin*. Advances and new insights in naturally colored cotton breeding and research. Industrial Crops & Products, 2024, 211:118252.
12.Guannan Zhao, Yu Le, Mengling Sun, Jiawen Xu, Yuan Qin, She Men, Zhengxiu Ye, Haozhe Tan, Haiyan Hu, Jiaqi You, Jianying Li, Shuangxia Jin, Maojun Wang, Xianlong Zhang, Zhongxu Lin*, Lili Tu*. A dominant negative mutation of GhMYB25-like alters cotton fiber initiation, reducing lint and fuzz. The Plant Cell, 2024, 36, (8), 2759-2777.
14.Nian Wang, Yuanxue Li, Qingying Meng, Meilin Chen, Mi Wu, Ruiting Zhang, Zhiyong Xu, Jie Sun, Xianlong Zhang, Xinhui Nie*, Daojun Yuan*, Zhongxu Lin*. Genome and haplotype provide insights into the population differentiation and breeding improvement of Gossypium barbadense. Journal of Advanced Research, 2023, 54:15–27.
15.Yang Yang, Chunyuan You, Nian Wang, Mi Wu, Yu Le, Maojun Wang, Xianlong Zhang, Yu Yu*, Zhongxu Lin*. Gossypium mustelinum genome and an introgression population enrich interspecific genetics and breeding in cotton. Theoretical and Applied Genetics, 2023, 136:130.
18.Nian Wang, Yuanxue Li, Chao Shen, Yang Yang, Hongya Wang, Tian Yao, Xianlong Zhang, Keith Lindsey, Zhongxu Lin*. High-resolution sequencing of nine elite upland cotton cultivars uncovers genic variations and breeding improvement targets. The Plant Journal, 2023, 113 (1): 145-159.
19.Ruiting Zhang, Chao Shen, De Zhu, Yu Le, Nian Wang, Yuanxue Li, Xianlong Zhang & Zhongxu Lin*. Fine-mapping and candidate gene analysis of qFL-c10-1 controlling fiber length in upland cotton (Gossypium hirsutum L.). Theoretical and Applied Genetics, 2022, 135 (12), 4483–4494.
20.Nian Wang, Beibei Zhang, Tian Yao, Chao Shen, Tianwang Wen, Ruiting Zhang, Yuanxue Li, Yu Le, Zhonghua Li, Xianlong Zhang and Zhongxu Lin*. Re enhances anthocyanin and proanthocyanidin accumulation to produce red foliated cotton and brown fiber. Plant Physiology, 2022: 189: 1466–1481.
21.Bin Gao, Gaofeng Ren, Tianwang Wen, Haiping Li, Xianlong Zhang, Zhongxu Lin*. A super PPR cluster for restoring fertility revealed by genetic mapping, homocap-seq and de novo assembly in cotton. Theoretical and Applied Genetics, 2022, 135: 637-652.
24.Cong Huang, Chao Shen, Tianwang Wen, Bin Gao, De Zhu, Dingguo Li*, Zhongxu Lin*. Genome-wide association mapping for agronomic traits in an 8-way Upland cotton MAGIC population by SLAF-seq. Theoretical and Applied Genetics, 2021, 134: 2459-2468.
26.De Zhu, Yu Le, Ruiting Zhang, Xiaojing Li and Zhongxu Lin*. A global survey of the gene network and key genes for oil accumulation in cultivated tetraploid cottons. Plant Biotechnology Journal, 2021, 19 (6): 1170-1182.
27.Chao Shen, Nian Wang, De Zhu, Pengcheng Wang, Maojun Wang, Tianwang Wen, Yu Le, Mi Wu, Tian Yao, Xianlong Zhang, Zhongxu Lin*. Gossypium tomentosum genome and interspecific ultra-dense genetic maps reveal genomic structures, recombination landscape and flowering depression in cotton. Genomics, 2021, 113, 1999-2009.
五、教材与著作
《植物生物技术》（第三版），参编，2022，科学出版社
教育部
