石河子大学农学院的前身是成立于1959的新疆生产建设兵团农学院，1996年6月四校合并为石河子大学时成立石河子大学农学院，现有农学系、植物保护系、农业资源与环境系、园艺系和林学系5个系和棉花研究所、小麦研究所、试验站3个教学科研机构。
   农学院现有教职工172人，其中，专任教师130人。专任教师中教授45人，副教授63人，讲师22人，具有副高以上职称教师占教师总数的74%；专任教师中博士学位教师105人，硕士学位教师21人，学士学位教师4人，硕士以上学历教师占专任教师数量的96.9%。教师入选国家级人才3人，享受国务院特贴专家6人，科技部创新团队带头人1人，教育部新世纪优秀人才2人，新疆自治区教学名师1人，新疆自治区有突出贡献中青年专家2人，兵团特聘专家1人，兵团创新团队带头人2人，兵团首批突出贡献优秀专家1人，兵团学术带头人4人，“兵团英才”第一层次3人，“兵团英才”第二层次2人，“兵团英才”第三层次5人，校级领军人才2人，校级拔尖人才2人，校级学科带头人7人，校级学术骨干55名。全院教师共建成国家级教学团队2个，校级教学团队2个，科技部创新团队1个，兵团创新团队2个。
   学院以培养创新性应用型复合人才为目标，全面推进本科卓越农林人才工程和研究生创新培育工程，现有农学、种子科学与工程、植物保护、农业资源与环境、园艺、设施农业科学与工程、林学、园林等8个本科专业；有作物学、植物保护学、园艺学、农业资源与环境4个一级学科硕士点和作物学、园艺学2个一级学科博士点，1个作物学博士后流动站。学院有国家级特色专业1个，国家级教学团队2个；有国家级精品课程2门，省级精品课程6门，省级实验教学示范中心1个。近三年，学院教师主持国家级教改项目2项，校级教改项目11项。4人入选首批全国万名优秀创新创业导师人才库，1人获全国模范教师，1人获全国民族团结进步先进个人，1人获全国青年教师教学比赛二等奖。1人入选2017年度全国教书育人楷模候选人。
学院持续强化基地和团队建设。现有作物学国家一级重点学科1个，作物学、植物保护学新疆维吾尔自治区重点一级学科2个，园艺学兵团重点学科1个；作物学入选自治区高峰学科，植物保护学科入选自治区高原学科。建有绿洲作物高效生产与农业环境保护科技部国际科技合作基地1个，新疆生产建设兵团绿洲生态农业重点实验室1个，特色果蔬栽培生理与种质资源创新利用新疆生产建设兵团重点实验室1个，新疆绿洲农业病虫害治理与植保资源利用自治区高校重点实验室1个，兵团林业害虫预测预报检验中心1个。现有教育部科技创新团队1个，新疆生产建设兵团科技创新团队3个，新疆生产建设兵团2011协同创新中心1个。
   学院以服务新疆及兵团经济建设和社会发展为宗旨，聚焦新疆及兵团优势产业开展科学研究和社会服务。近5年学院获批国家级科研项目113余项，其中国家自然基金95项，到位科研经费1.2亿余元，发表SCI论文118篇，EI论文29篇，获专利登记知识产权保护及新品种审定44项，出版学术专著50余部，获省部级以上科研奖励19项。针对新疆及兵团农业生产，开展基层农技人员培训、现场技术指导、定点服务等技术服务形式，累计派出2000多人次服务基层一线，累计培训人员近万人，通过技术推广与示范，累计为服务单位和农户增收近10亿元。1人获科技部优秀科技特派员通报表扬。
  学院先后与美国、澳大利亚、日本哈萨克斯坦、巴基斯坦等国家的大学和科研机构建立了长期合作关系，同时积极利用华中农业大学对口支援的契机，聘请知名专家来我校讲学和开展科研合作，10余人担任国内学会理事、国内期刊编委。

2020年11月